指纹其实是比较复杂的。与人工处理不同，许多生物识别技术公司并不直接存储指纹的图像。多年来在各个公司及其研究机构产生了许多数字化的算法(美国有关法律认为，指纹图像属于个人隐私，因此不能直接处理指纹图像)。

　　指纹门禁机指纹识别算法最终都归结为在指纹图像上找到并比对指纹的特征。因为每个人的包括指纹在内的皮肤纹路在图案、断点和交叉点上各不相同，也就是说，是唯一的，并且终生不变。依靠这种唯一性和稳定性，我们就可以把一个人同他的指纹对应起来，通过比较他的指纹和预先保存的指纹进行比较，就可以验证他的真实身份。

　　自动指纹识别技术的发展得益于现代电子集成制造技术和快速而可靠的算法研究。尽管指纹只是人体皮肤的一小部分，但用于识别的数据量相当大，对这些数据进行比对也不是简单的相等与不相等的问题，而是使用需要进行大量运算的模糊匹配算法。现代电子集成制造技术使得我们可以制造相当小的指纹图象读取设备，同时飞速发展的个人计算机运算速度提供了在微机甚至单片机上可以进行两个指纹的比对运算的可能。

　　有些人的指纹很淡，无法采集到符合电脑自动识别技术需求的指纹信息，可以尝试十个手指，如果十个手指的指纹都无法采集，可以给当事人密码身份认证。60岁以上老人，长期在化学腐蚀环境作业的工人，经常使用洗洁精的家庭主妇等的中指和拇指及食指的指纹纹路收到严重影响，可以尝试小指和无名指。确实无法采集的人，使用密码进行身份验证。

　　指纹IC卡系统用IC卡保存指纹特征数据、使用人员信息、私钥等关键信息、通过指纹识别认证持卡人真实身份，是提高电子支付信用卡信誉、解决网络信息安全瓶颈最有效的手段，是对信息安全(软件)认证、密钥体系最有效的补充。既是IC卡应用更高层次的系统创新，又是用户真实身份认证领域的一次革命。指纹门禁机读卡器验证卡的有效性，后指纹身份验证，通过双重验证，确保系统安全可靠，保护资源不被侵犯。