1996年，包起帆把目标瞄准了小件杂货的集装箱化和散货的专业化革新，建立内贸集装箱运输模式，在交通部和港航单位的支持下，1996年12月15日，中国水运史上第一条内贸标准集装箱航线在上海龙吴码头开通。

　　进入新世纪，包起帆凭着对国际港口业整体发展趋势的敏锐把握，果断把攻关的矛头对准了世界集装箱码头研究的最前端——集装箱自动化堆场上，把研究的重点放在了如何实现码头操控“无人化”上。包起帆的团队一次又一次召集团队研究试验，认真探究着方案的优化改进，最终攻下了这道世界难题：集装箱自动化堆场及堆场装卸工艺。这项工艺使现场无人指挥，吊车无人驾驶，集卡不用逗留，叉车不再出现，所有的指令都从两公里以外的控制中心发出，一切都显得有序、从容。巴黎发明展览会上，这项成果以其先进的设计理念、过硬的技术系统、扎实的试验数据，获得了25位权威评委的一致赞赏，无可争议地赢得了金奖。

　　包起帆在巴黎国际发明展上还获得了三个金奖——“集装箱电子标签系统”“用于集装箱的电子标签和电子封条的连接方法”“用于集装箱作业的安全装置”，同样瞄准了国际最前沿。前两个创新成果，一举实现了集装箱运输全过程的实时监控和信息传递，巴黎发明展览会评委主席赞叹道“这将是一场改变人们运输方式的革命”。第三项发明则攻克了集装箱作业安全领域内困扰人们许久的一个重大现实问题。包起帆一人获得四项金牌，打破了展会的历史纪录。

　　党的十八大以后，党中央国务院大力倡导工匠精神。包起帆在接受媒体采访时表示，工匠精神体现的是生产者在技艺和工艺流程上的精益求精，将产品打造成精致的艺术品的精神，同时也是不断将新技术融入产品中，形成的一种持续创新的精神。无论是好的产品还是好的服务，不是说出来的，一定是做出来的。现在国家倡导工匠精神，这就更需要我们去落实，在社会上要形成重视工匠、尊重工匠的好的风气。